基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟

 随着生物多样性全球大会的举办,不论是管理机构及科研单位、高校都在积极准备,根据国家林草局最新工作指示,我国将积极整合、优化自然保护地,加快推进国家公园体制试点,构建以国家公园为主体的自然保护地体系。针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题,科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。

BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型,模拟特定物种与其环境之间的关系,试图利用环境变量来模拟特定物种的生态位,

专题一:BIOMOD2模型概述
R平台下软件包的安装

软件包的功能、模型介绍
物种分布的基本原理
物种分布模型的发展、种类及评价方法
影响物种分布模型准确性的因素

专题二:BIOMOD2模型运行
2.1物种分布文件的建立

数据获取的途径与方法
物种分布的确认与筛选
数据文件的格式
2.2环境变量的选择
环境变量获取的途径与方法
环境变量的选择及处理方法
图层处理
2.3 模型参数及其设置
模型的训练、检验
权重设置
Pseudo-absences数据及设置
2.4 模型算法介绍及主要参数
模型包括: GLM、GBM、GAM、CTA、ANN、SRE、FDA、MARS、RF和MAXENT.Phillips

专题三:BIOMOD2模型运行结果的分析与解释
模型效果的评估
变量的贡献(重要性)
响应曲线

专题四:BIOMOD2模型的预测及分析
未来气候变化下的情景预测
物种适生区的变化、转化率等
MESS分析过程及实现

专题五:BIOMOD2模型的应用案例 
基于单个模型算法(MAXENT)的案例
基于组合预测模型的应用案例

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