plink软件合并不同染色体的数据

 

001、测试数据

(base) [root@PC1 test]# ls
chr_1.bed  chr_1.bim  chr_1.fam  chr_2.bed  chr_2.bim  chr_2.fam  chr_3.bed  chr_3.bim  chr_3.fam  merge_list.txt
(base) [root@PC1 test]# cat merge_list.txt
chr_1.bed chr_1.bim chr_1.fam
chr_2.bed chr_2.bim chr_2.fam
chr_3.bed chr_3.bim chr_3.fam

 

 

002、合并命令

plink --bfile chr_1 --merge-list merge_list.txt --make-bed --out merged_data

 

003、配置文件格式

(base) [root@PC1 test]# cat merge_list.txt
chr_1.bed chr_1.bim chr_1.fam
chr_2.bed chr_2.bim chr_2.fam
chr_3.bed chr_3.bim chr_3.fam

 。