innoDB

3.23就有了innoDB引擎，5.5成为了默认引擎，支持外键
是一种事务型引擎，可以保证完整提交和回滚
更新、删除比较多的场景，推荐使用innoDB
不过innoDB对内存要求高，因为索引和数据存到一个表了；写操作的效率差

MyISAM

是非事务型引擎，对增加和查找支持的比较好访问速度快
对COUNT(*)这种对数据统计任务有专门的变量存储，O(1)级别的
不支持事务、行级锁、外键，尤其是崩溃后无法恢复

区别

磁盘文件

索引支持

innoDB支持聚簇（通常是主键）索引，MyISAM不支持（因为聚簇索引要求索引键和行数据必须在物理空间上连续）

事务机制

innoDB有undo-log和redo-log。
undo-log是磁盘中记载变更前的旧数据，rollback的话会根据undo-log覆盖缓冲区（undo_log_buffer，在内存中）中变更后的数据。以此保证事务的原子性。
redo-log是磁盘中记录数据用的，数据库宕机后，可以根据日志恢复数据。只要事务commit，能够保证该事务数据不会丢失。保证了事务的持久性。
MyISAM这几个都不行

锁粒度

MyISAM只能表锁，而innoDB表锁、行锁都可以