中药网络药理学-教程(全网最牛逼)
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1. 首先uniprot官网下载数据
1.1. 数据下载
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地址:https://www.uniprot.org/
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![外链图片
ge-20240410212513022.png&pos_id=img-WfyqlIze-1713321792128) -
我这里研究的是胶质母细胞瘤(GBM),glioblastoma ,输入进去,然后就会得到对应的数据
- 这里需要注意,不能直接下载txt文件,我们这里需要下载tsv的文件,然后进行转换为txt文件
1.2. 数据整理
1.3. 新建文件夹[代码处理]
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新建文件夹,命名为:1uniprot,如图所示:
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import pandas as pd# 读取.tsv文件 df = pd.read_csv('uniprotkb_glioblastoma.tsv', sep='\t')# 将DataFrame写入.txt文件 df.to_csv('ann.txt', sep='\t', index=False)
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我们将文件转换为.txt的格式
2. 疾病中药交集
2.1. 找到中药的复方药剂
2.1.1. 首先去TCSMP官网
- 地址:https://old.tcmsp-e.com/