2024-中药网络药理学-教程(全网最牛逼)

中药网络药理学-教程(全网最牛逼)

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1. 首先uniprot官网下载数据

1.1. 数据下载

  • 地址:https://www.uniprot.org/

  • ![外链图片在这里插入图片描述
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    ge-20240410212513022.png&pos_id=img-WfyqlIze-1713321792128)

  • 我这里研究的是胶质母细胞瘤(GBM),glioblastoma ,输入进去,然后就会得到对应的数据

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  • 这里需要注意,不能直接下载txt文件,我们这里需要下载tsv的文件,然后进行转换为txt文件
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1.2. 数据整理

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1.3. 新建文件夹[代码处理]

  • 新建文件夹,命名为:1uniprot,如图所示:

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  • import pandas as pd# 读取.tsv文件
    df = pd.read_csv('uniprotkb_glioblastoma.tsv', sep='\t')# 将DataFrame写入.txt文件
    df.to_csv('ann.txt', sep='\t', index=False)
    
  • 我们将文件转换为.txt的格式

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2. 疾病中药交集

2.1. 找到中药的复方药剂

2.1.1. 首先去TCSMP官网
  • 地址:https://old.tcmsp-e.com/

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