phylip 中利用NJ法构建进化树-编程知识

phylip 中利用NJ法构建进化树

news/2025/3/5 23:39:13/文章来源:https://www.cnblogs.com/liujiaxin2018/p/18754025

001、测试文件vcf文件

(base) [b20223040323@admin2 02_NJ_tree]$ ls
outcome.vcf

002、格式转换；输入文件为vcf文件

run_pipeline.pl -Xms1G -Xmx5G -importGuess outcome.vcf -ExportPlugin -saveAs sequences.phy -format Phylip_Inter       ## 格式转换

003、

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